SMAD7

SMAD7
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2DJY, 2LTV, 2LTW, 2LTX, 2LTY, 2LTZ, 2KXQ

Ідентифікатори
Символи SMAD7, CRCS3, MADH7, MADH8, SMAD family member 7
Зовнішні ІД OMIM: 602932 MGI: 1100518 HomoloGene: 4314 GeneCards: SMAD7
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
beta-catenin binding
type I transforming growth factor beta receptor binding
collagen binding
I-SMAD binding
activin binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
зв'язування з іоном металу
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
ubiquitin protein ligase binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific

Клітинна компонента

цитоплазма
центросома
transcription regulator complex
клітинна мембрана
внутрішньоклітинний
нуклеоплазма
catenin complex
клітинне ядро
fibrillar center
гіалоплазма
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

cellular response to transforming growth factor beta stimulus
regulation of ventricular cardiac muscle cell membrane depolarization
pathway-restricted SMAD protein phosphorylation
ureteric bud development
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
adherens junction assembly
positive regulation of cell-cell adhesion
ventricular septum morphogenesis
regulation of epithelial to mesenchymal transition
negative regulation of peptidyl-threonine phosphorylation
negative regulation of transcription by competitive promoter binding
response to laminar fluid shear stress
protein stabilization
regulation of activin receptor signaling pathway
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
BMP signaling pathway
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
negative regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation
negative regulation of BMP signaling pathway
ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis
negative regulation of protein ubiquitination
negative regulation of cell migration
negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity
artery morphogenesis
negative regulation of peptidyl-serine phosphorylation
regulation of cardiac muscle contraction
positive regulation of protein ubiquitination
positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process
negative regulation of epithelial to mesenchymal transition
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
transcription, DNA-templated
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
protein deubiquitination
negative regulation of T cell cytokine production
negative regulation of T-helper 17 type immune response
negative regulation of T-helper 17 cell differentiation
cellular response to leukemia inhibitory factor

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4092
17131
Ensembl
ENSG00000101665
ENSMUSG00000025880
UniProt
O15105
O35253
RefSeq (мРНК)
NM_005904
NM_001190821
NM_001190822
NM_001190823
NM_001042660
NM_008543
RefSeq (білок)
NP_001177750
NP_001177751
NP_001177752
NP_005895
NP_001036125
Локус (UCSC) Хр. 18: 48.92 – 48.95 Mb Хр. 18: 75.5 – 75.53 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SMAD7 (англ. SMAD family member 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 426 амінокислот, а молекулярна маса — 46 426[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MFRTKRSALVRRLWRSRAPGGEDEEEGAGGGGGGGELRGEGATDSRAHGA
GGGGPGRAGCCLGKAVRGAKGHHHPHPPAAGAGAAGGAEADLKALTHSVL
KKLKERQLELLLQAVESRGGTRTACLLLPGRLDCRLGPGAPAGAQPAQPP
SSYSLPLLLCKVFRWPDLRHSSEVKRLCCCESYGKINPELVCCNPHHLSR
LCELESPPPPYSRYPMDFLKPTADCPDAVPSSAETGGTNYLAPGGLSDSQ
LLLEPGDRSHWCVVAYWEEKTRVGRLYCVQEPSLDIFYDLPQGNGFCLGQ
LNSDNKSQLVQKVRSKIGCGIQLTREVDGVWVYNRSSYPIFIKSATLDNP
DSRTLLVHKVFPGFSIKAFDYEKAYSLQRPNDHEFMQQPWTGFTVQISFV
KGWGQCYTRQFISSCPCWLEVIFNSR

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Massague J. (1998). TGF-beta signal transduction. Annu. Rev. Biochem. 67: 753—791. PMID 9759503 DOI:10.1146/annurev.biochem.67.1.753
  • Verschueren K., Huylebroeck D. (1999). Remarkable versatility of Smad proteins in the nucleus of transforming growth factor-beta activated cells. Cytokine Growth Factor Rev. 10: 187—199. PMID 10647776 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00012-X
  • Lebrun J.J., Takabe K., Chen Y., Vale W. (1999). Roles of pathway-specific and inhibitory Smads in activin receptor signaling. Mol. Endocrinol. 13: 15—23. PMID 9892009 DOI:10.1210/mend.13.1.0218
  • Wrana J.L., Attisano L. (2000). The Smad pathway. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 5—13. PMID 10708948 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00024-6
  • Miyazono K. (2000). TGF-beta signaling by Smad proteins. Cytokine Growth Factor Rev. 11: 15—22. PMID 10708949 DOI:10.1016/S1359-6101(99)00025-8

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з SMAD7 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6773 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, O15105 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 18

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.