CEBPB

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1GTW, 1GU4, 1GU5, 1H88, 1H89, 1H8A, 1HJB, 1IO4, 2E42, 2E43

Ідентифікатори

Символи

CEBPB, C/EBP-beta, IL6DBP, NF-IL6, TCF5, CCAAT/enhancer binding protein beta, CCAAT enhancer binding protein beta

Зовнішні ІД

OMIM: 189965 MGI: 88373 HomoloGene: 3807 GeneCards: CEBPB

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • histone deacetylase binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • ubiquitin-like protein ligase binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • glucocorticoid receptor binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • nuclear matrix • CHOP-C/EBP complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • condensed chromosome, centromeric region • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • mammary gland epithelial cell proliferation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • embryonic placenta development • пам'ять • positive regulation of interleukin-4 production • response to endoplasmic reticulum stress • mammary gland epithelial cell differentiation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of T cell proliferation • liver regeneration • positive regulation of osteoblast differentiation • hepatocyte proliferation • response to lipopolysaccharide • regulation of osteoclast differentiation • defense response to bacterium • acute-phase response • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • neuron differentiation • cellular response to interleukin-1 • brown fat cell differentiation • cellular response to amino acid stimulus • ovarian follicle development • liver development • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fat cell differentiation • cellular response to lipopolysaccharide • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • transcription by RNA polymerase II • granuloma formation • T-helper 1 cell activation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of odontoblast differentiation • positive regulation of biomineral tissue development • positive regulation of sodium-dependent phosphate transport • positive regulation of inflammatory response • positive regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of dendritic cell differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1051


12608

Ensembl


ENSG00000172216


ENSMUSG00000056501

UniProt


P17676


P28033

RefSeq (мРНК)


NM_005194 NM_001285878 NM_001285879


NM_001287738 NM_001287739 NM_009883

RefSeq (білок)


NP_001272807 NP_001272808 NP_005185


NP_001274667 NP_001274668 NP_034013

Локус (UCSC)

Хр. 20: 50.19 – 50.19 Mb

Хр. 2: 167.53 – 167.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CEBPB (англ. CCAAT/enhancer binding protein beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 345 амінокислот, а молекулярна маса — 36 106^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQRLVAWDPA	CLPLPPPPPA	FKSMEVANFY	YEADCLAAAY	GGKAAPAAPP
AARPGPRPPA	GELGSIGDHE	RAIDFSPYLE	PLGAPQAPAP	ATATDTFEAA
PPAPAPAPAS	SGQHHDFLSD	LFSDDYGGKN	CKKPAEYGYV	SLGRLGAAKG
ALHPGCFAPL	HPPPPPPPPP	AELKAEPGFE	PADCKRKEEA	GAPGGGAGMA
AGFPYALRAY	LGYQAVPSGS	SGSLSTSSSS	SPPGTPSPAD	AKAPPTACYA
GAAPAPSQVK	SKAKKTVDKH	SDEYKIRRER	NNIAVRKSRD	KAKMRNLETQ
HKVLELTAEN	ERLQKKVEQL	SRELSTLRNL	FKQLPEPLLA	SSGHC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kinoshita S., Akira S., Kishimoto T. (1992). A member of the C/EBP family, NF-IL6 beta, forms a heterodimer and transcriptionally synergizes with NF-IL6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 1473—1476. PMID 1741402 DOI:10.1073/pnas.89.4.1473
Chinery R., Brockman J.A., Dransfield D.T., Coffey R.J. (1997). Antioxidant-induced nuclear translocation of CCAAT/enhancer-binding protein beta. A critical role for protein kinase A-mediated phosphorylation of Ser299. J. Biol. Chem. 272: 30356—30361. PMID 9374525 DOI:10.1074/jbc.272.48.30356
Podust L.M., Krezel A.M., Kim Y. (2001). Crystal structure of the CCAAT box/enhancer-binding protein beta activating transcription factor-4 basic leucine zipper heterodimer in the absence of DNA. J. Biol. Chem. 276: 505—513. PMID 11018027 DOI:10.1074/jbc.M005594200
Buck M., Poli V., Hunter T., Chojkier M. (2001). C/EBPbeta phosphorylation by RSK creates a functional XEXD caspase inhibitory box critical for cell survival. Mol. Cell. 8: 807—816. PMID 11684016 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00374-4
Zhu Y., Saunders M.A., Yeh H., Deng W.G., Wu K.K. (2002). Dynamic regulation of cyclooxygenase-2 promoter activity by isoforms of CCAAT/enhancer-binding proteins. J. Biol. Chem. 277: 6923—6928. PMID 11741938 DOI:10.1074/jbc.M108075200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1834 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P17676 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма