SPEN

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1OW1, 2RT5, 4P6Q

Ідентифікатори

Символи

SPEN, HIAA0929, MINT, RBM15C, SHARP, spen family transcriptional repressor, RATARS

Зовнішні ІД

OMIM: 613484 MGI: 1891706 HomoloGene: 124461 GeneCards: SPEN

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity
Клітинна компонента	• transcription repressor complex • екзосома • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес	• Сигнальний шлях Notch • positive regulation of neurogenesis • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23013


56381

Ensembl


ENSG00000065526


ENSMUSG00000040761

UniProt


Q96T58


Q62504

RefSeq (мРНК)


NM_015001


NM_019763 NM_001347235

RefSeq (білок)


NP_055816


NP_001334164 NP_062737

Локус (UCSC)

Хр. 1: 15.84 – 15.94 Mb

Хр. 4: 141.2 – 141.27 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SPEN (англ. Spen family transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 664 амінокислот, а молекулярна маса — 402 248^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVRETRHLWV	GNLPENVREE	KIIEHFKRYG	RVESVKILPK	RGSEGGVAAF
VDFVDIKSAQ	KAHNSVNKMG	DRDLRTDYNE	PGTIPSAARG	LDDTVSIASR
SREVSGFRGG	GGGPAYGPPP	SLHAREGRYE	RRLDGASDNR	ERAYEHSAYG
HHERGTGGFD	RTRHYDQDYY	RDPRERTLQH	GLYYASRSRS	PNRFDAHDPR
YEPRAREQFT	LPSVVHRDIY	RDDITREVRG	RRPERNYQHS	RSRSPHSSQS
RNQSPQRLAS	QASRPTRSPS	GSGSRSRSSS	SDSISSSSST	SSDSSDSSSS
SSDDSPARSV	QSAAVPAPTS	QLLSSLEKDE	PRKSFGIKVQ	NLPVRSTDTS
LKDGLFHEFK	KFGKVTSVQI	HGTSEERYGL	VFFRQQEDQE	KALTASKGKL
FFGMQIEVTA	WIGPETESEN	EFRPLDERID	EFHPKATRTL	FIGNLEKTTT
YHDLRNIFQR	FGEIVDIDIK	KVNGVPQYAF	LQYCDIASVC	KAIKKMDGEY
LGNNRLKLGF	GKSMPTNCVW	LDGLSSNVSD	QYLTRHFCRY	GPVVKVVFDR
LKGMALVLYN	EIEYAQAAVK	ETKGRKIGGN	KIKVDFANRE	SQLAFYHCME
KSGQDIRDFY	EMLAERREER	RASYDYNQDR	TYYESVRTPG	TYPEDSRRDY
PARGREFYSE	WETYQGDYYE	SRYYDDPREY	RDYRNDPYEQ	DIREYSYRQR
ERERERERFE	SDRDRDHERR	PIERSQSPVH	LRRPQSPGAS	PSQAERLPSD
SERRLYSRSS	DRSGSCSSLS	PPRYEKLDKS	RLERYTKNEK	TDKERTFDPE
RVERERRLIR	KEKVEKDKTD	KQKRKGKVHS	PSSQSSETDQ	ENEREQSPEK
PRSCNKLSRE	KADKEGIAKN	RLELMPCVVL	TRVKEKEGKV	IDHTPVEKLK
AKLDNDTVKS	SALDQKLQVS	QTEPAKSDLS	KLESVRMKVP	KEKGLSSHVE
VVEKEGRLKA	RKHLKPEQPA	DGVSAVDLEK	LEARKRRFAD	SNLKAEKQKP
EVKKSSPEME	DARVLSKKQP	DVSSREVILL	REGEAERKPV	RKEILKRESK
KIKLDRLNTV	ASPKDCQELA	SISVGSGSRP	SSDLQARLGE	LAGESVENQE
VQSKKPIPSK	PQLKQLQVLD	DQGPEREDVR	KNYCSLRDET	PERKSGQEKS
HSVNTEEKIG	IDIDHTQSYR	KQMEQSRRKQ	QMEMEIAKSE	KFGSPKKDVD
EYERRSLVHE	VGKPPQDVTD	DSPPSKKKRM	DHVDFDICTK	RERNYRSSRQ
ISEDSERTGG	SPSVRHGSFH	EDEDPIGSPR	LLSVKGSPKV	DEKVLPYSNI
TVREESLKFN	PYDSSRREQM	ADMAKIKLSV	LNSEDELNRW	DSQMKQDAGR
FDVSFPNSII	KRDSLRKRSV	RDLEPGEVPS	DSDEDGEHKS	HSPRASALYE
SSRLSFLLRD	REDKLRERDE	RLSSSLERNK	FYSFALDKTI	TPDTKALLER
AKSLSSSREE	NWSFLDWDSR	FANFRNNKDK	EKVDSAPRPI	PSWYMKKKKI
RTDSEGKMDD	KKEDHKEEEQ	ERQELFASRF	LHSSIFEQDS	KRLQHLERKE
EDSDFISGRI	YGKQTSEGAN	STTDSIQEPV	VLFHSRFMEL	TRMQQKEKEK
DQKPKEVEKQ	EDTENHPKTP	ESAPENKDSE	LKTPPSVGPP	SVTVVTLESA
PSALEKTTGD	KTVEAPLVTE	EKTVEPATVS	EEAKPASEPA	PAPVEQLEQV
DLPPGADPDK	EAAMMPAGVE	EGSSGDQPPY	LDAKPPTPGA	SFSQAESNVD
PEPDSTQPLS	KPAQKSEEAN	EPKAEKPDAT	ADAEPDANQK	AEAAPESQPP
ASEDLEVDPP	VAAKDKKPNK	SKRSKTPVQA	AAVSIVEKPV	TRKSERIDRE
KLKRSNSPRG	EAQKLLELKM	EAEKITRTAS	KNSAADLEHP	EPSLPLSRTR
RRNVRSVYAT	MGDHENRSPV	KEPVEQPRVT	RKRLERELQE	AAAVPTTPRR
GRPPKTRRRA	DEEEENEAKE	PAETLKPPEG	WRSPRSQKTA	AGGGPQGKKG
KNEPKVDATR	PEATTEVGPQ	IGVKESSMEP	KAAEEEAGSE	QKRDRKDAGT
DKNPPETAPV	EVVEKKPAPE	KNSKSKRGRS	RNSRLAVDKS	ASLKNVDAAV
SPRGAAAQAG	ERESGVVAVS	PEKSESPQKE	DGLSSQLKSD	PVDPDKEPEK
EDVSASGPSP	EATQLAKQME	LEQAVEHIAK	LAEASASAAY	KADAPEGLAP
EDRDKPAHQA	SETELAAAIG	SIINDISGEP	ENFPAPPPYP	GESQTDLQPP
AGAQALQPSE	EGMETDEAVS	GILETEAATE	SSRPPVNAPD	PSAGPTDTKE
ARGNSSETSH	SVPEAKGSKE	VEVTLVRKDK	GRQKTTRSRR	KRNTNKKVVA
PVESHVPESN	QAQGESPAAN	EGTTVQHPEA	PQEEKQSEKP	HSTPPQSCTS
DLSKIPSTEN	SSQEISVEER	TPTKASVPPD	LPPPPQPAPV	DEEPQARFRV
HSIIESDPVT	PPSDPSIPIP	TLPSVTAAKL	SPPVASGGIP	HQSPPTKVTE
WITRQEEPRA	QSTPSPALPP	DTKASDVDTS	SSTLRKILMD	PKYVSATSVT
STSVTTAIAE	PVSAAPCLHE	APPPPVDSKK	PLEEKTAPPV	TNNSEIQASE
VLVAADKEKV	APVIAPKITS	VISRMPVSID	LENSQKITLA	KPAPQTLTGL
VSALTGLVNV	SLVPVNALKG	PVKGSVTTLK	SLVSTPAGPV	NVLKGPVNVL
TGPVNVLTTP	VNATVGTVNA	APGTVNAAAS	AVNATASAVT	VTAGAVTAAS
GGVTATTGTV	TMAGAVIAPS	TKCKQRASAN	ENSRFHPGSM	PVIDDRPADA
GSGAGLRVNT	SEGVVLLSYS	GQKTEGPQRI	SAKISQIPPA	SAMDIEFQQS
VSKSQVKPDS	VTASQPPSKG	PQAPAGYANV	ATHSTLVLTA	QTYNASPVIS
SVKADRPSLE	KPEPIHLSVS	TPVTQGGTVK	VLTQGINTPP	VLVHNQLVLT
PSIVTTNKKL	ADPVTLKIET	KVLQPANLGS	TLTPHHPPAL	PSKLPTEVNH
VPSGPSIPAD	RTVSHLAAAK	LDAHSPRPSG	PGPSSFPRAS	HPSSTASTAL
STNATVMLAA	GIPVPQFISS	IHPEQSVIMP	PHSITQTVSL	SHLSQGEVRM
NTPTLPSITY	SIRPEALHSP	RAPLQPQQIE	VRAPQRASTP	QPAPAGVPAL
ASQHPPEEEV	HYHLPVARAT	APVQSEVLVM	QSEYRLHPYT	VPRDVRIMVH
PHVTAVSEQP	RAADGVVKVP	PASKAPQQPG	KEAAKTPDAK	AAPTPTPAPV
PVPVPLPAPA	PAPHGEARIL	TVTPSNQLQG	LPLTPPVVVT	HGVQIVHSSG
ELFQEYRYGD	IRTYHPPAQL	THTQFPAASS	VGLPSRTKTA	AQGPPPEGEP
LQPPQPVQST	QPAQPAPPCP	PSQLGQPGQP	PSSKMPQVSQ	EAKGTQTGVE
QPRLPAGPAN	RPPEPHTQVQ	RAQAETGPTS	FPSPVSVSMK	PDLPVSLPTQ
TAPKQPLFVP	TTSGPSTPPG	LVLPHTEFQP	APKQDSSPHL	TSQRPVDMVQ
LLKKYPIVWQ	GLLALKNDTA	AVQLHFVSGN	NVLAHRSLPL	SEGGPPLRIA
QRMRLEATQL	EGVARRMTVE	TDYCLLLALP	CGRDQEDVVS	QTESLKAAFI
TYLQAKQAAG	IINVPNPGSN	QPAYVLQIFP	PCEFSESHLS	RLAPDLLASI
SNISPHLMIV	IASV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Shi Y., Hon M., Evans R.M. (2002). The peroxisome proliferator-activated receptor delta, an integrator of transcriptional repression and nuclear receptor signaling. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 2613—2618. PMID 11867749 DOI:10.1073/pnas.052707099
Ariyoshi M., Schwabe J.W.R. (2003). A conserved structural motif reveals the essential transcriptional repression function of Spen proteins and their role in developmental signaling. Genes Dev. 17: 1909—1920. PMID 12897056 DOI:10.1101/gad.266203

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17575 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96T58 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.