RNASEH1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2QK9, 2QKB, 2QKK, 3BSU

Ідентифікатори

Символи

RNASEH1, H1RNA, RNH1, PEOB2, ribonuclease H1

Зовнішні ІД

OMIM: 604123 MGI: 1335073 HomoloGene: 2202 GeneCards: RNASEH1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nuclease activity • endonuclease activity • RNA-DNA hybrid ribonuclease activity • ribonuclease activity • hydrolase activity • magnesium ion binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес	• nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • Деградація РНК • DNA replication, removal of RNA primer • RNA phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


246243


19819

Ensembl


ENSG00000171865


ENSMUSG00000020630

UniProt


O60930


E9QLN8

RefSeq (мРНК)

NM_001286834 NM_001286837 NM_002936 NM_001378271 NM_001378272
NM_001378273


NM_001286865 NM_011275

RefSeq (білок)

NP_001273763 NP_001273766 NP_002927 NP_001365200 NP_001365201
NP_001365202


NP_001273794 NP_035405

Локус (UCSC)

Хр. 2: 3.54 – 3.56 Mb

Хр. 12: 28.7 – 28.71 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RNASEH1 (англ. Ribonuclease H1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 286 амінокислот, а молекулярна маса — 32 064^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSWLLFLAHR	VALAALPCRR	GSRGFGMFYA	VRRGRKTGVF	LTWNECRAQV
DRFPAARFKK	FATEDEAWAF	VRKSASPEVS	EGHENQHGQE	SEAKASKRLR
EPLDGDGHES	AEPYAKHMKP	SVEPAPPVSR	DTFSYMGDFV	VVYTDGCCSS
NGRRRPRAGI	GVYWGPGHPL	NVGIRLPGRQ	TNQRAEIHAA	CKAIEQAKTQ
NINKLVLYTD	SMFTINGITN	WVQGWKKNGW	KTSAGKEVIN	KEDFVALERL
TQGMDIQWMH	VPGHSGFIGN	EEADRLAREG	AKQSED

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Cerritelli S.M., Crouch R.J. (1998). Cloning, expression, and mapping of ribonucleases H of human and mouse related to bacterial RNase HI. Genomics. 53: 300—307. PMID 9799596 DOI:10.1006/geno.1998.5497
Wu H., Lima W.F., Crooke S.T. (1998). Molecular cloning and expression of cDNA for human RNase H. Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 8: 53—61. PMID 9512096 DOI:10.1089/oli.1.1998.8.53
Frank P., Braunshofer-Reiter C., Poltl A., Holzmann K. (1998). Cloning, subcellular localization and functional expression of human RNase HII. Biol. Chem. 379: 1407—1412. PMID 9894807 DOI:10.1515/bchm.1998.379.12.1407
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wu H., Lima W.F., Crooke S.T. (1999). Properties of cloned and expressed human RNase H1. J. Biol. Chem. 274: 28270—28278. PMID 10497183 DOI:10.1074/jbc.274.40.28270
Skourti-Stathaki K., Proudfoot N.J., Gromak N. (2011). Human senataxin resolves RNA/DNA hybrids formed at transcriptional pause sites to promote Xrn2-dependent termination. Mol. Cell. 42: 794—805. PMID 21700224 DOI:10.1016/j.molcel.2011.04.026

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18466 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, O60930 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.