LYNX1

LYNX1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2L03

Ідентифікатори
Символи LYNX1, SLURP2, Ly6/neurotoxin 1
Зовнішні ІД OMIM: 606110 MGI: 1345180 HomoloGene: 8026 GeneCards: LYNX1
Онтологія гена
Молекулярна функція

acetylcholine receptor inhibitor activity
ion channel inhibitor activity
acetylcholine receptor regulator activity
acetylcholine receptor binding

Клітинна компонента

extracellular region
anchored component of membrane
клітинна мембрана
дендрит (нейробіологія)
cell projection
екзосома
мембрана
міжклітинний простір
ендоплазматичний ретикулум

Біологічний процес

negative regulation of signaling receptor activity
synaptic transmission, cholinergic
regulation of molecular function
acetylcholine receptor signaling pathway
regulation of neurotransmitter receptor activity

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
66004
23936
Ensembl
ENSG00000180155
ENSMUSG00000022594
UniProt
P0DP57
P0DP58
P0DP60
RefSeq (мРНК)
NM_177457
NM_177476
NM_177477
NM_001356370
NM_011838
RefSeq (білок)
NP_803253
NP_001343301
NP_076435
NP_001343299
NP_803252
NP_803429
NP_803430
NP_035968
Локус (UCSC) Хр. 8: 142.77 – 142.78 Mb Хр. 15: 74.62 – 74.62 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LYNX1 (англ. Ly6/neurotoxin 1) - білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 8-ї хромосоми[3]. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 116 амінокислот, а молекулярна маса — 12641 Да[4]. Було виявлено різні варіанти альтернативного сплайсингу. Описано 6 ізоформ LYNX1: LYNX1-201 (230 bp), LYNX1-202 (639 bp), LYNX1-203 (563 bp), LYNX1-204 (4708 bp), LYNX1-205 (868 bp),- LYNX1-206 (4537bp), де LYNX1-201 не є білком[5].

Ген

LYNX1 розташовується у людей на довгому плечі 8-ї хромосоми. Ген містить 7 екзонів і охоплює 13,515 bp геномної ДНК.

Транскрипція між цим геном та сусіднім (SLURP2) формує транскрипти природного походження (LYNX1-SLURP2), які кодують химерний білок, що складається з послідовності, яку можна розділити на окремий генний продукт[4].

Поліморфізми

Для гену LYNX1 зараз нараховують близько 2500 SNP[6].

Послідовність амінокислот

Білок

Ген LYNX1 кодує білок (Lynx1), який є членом сімейства генів Ly-6 / нейротоксину, здатних модулювати рецептори нейромедіаторів; групи лімфоцитних антигенів, які прикріплюються до клітинної поверхні за допомогою глікозилфосфатидилінозитового якоря і мають унікальну структуру у вигляді збережених 8-10 залишків цистеїну з характерним просторовим патерном. Функціональний аналіз показує, що цей білок не є лігандом або нейротрансмітером, але має здатність посилювати функцію нікотинового ацетилхолінового рецептора в присутності ацетилхоліну. Цей ген також може грати роль в патогенезі вульгарного псоріазу[7].

Локалізація

Lynx1, зорова пластичність і пам'ять

Трансгенні миші без експресії Lynx1 не мають нормального критичного періоду нейропластичності в зоровій корі для розвитку домінування одного з очей[8]. Ці миші демонструють надзвичайно швидке одужання від амбліопії в дорослому віці, що вказує на роль в зниженні синаптичної пластичності під час нормальної експресії Lynx1 в дорослому мозку[9].

Lynx1 знижує пластичність зорової кори дорослої людини, зв'язуючись з нікотиновими рецепторами ацетилхоліну (NAchR) і зменшуючи передачу сигналів ацетилхоліну[10]. Після критичного періоду розвитку і в зрілому віці рівні мРНК та білка Lynx1 збільшуються в дорослому V1 і бічному колінчастому ядрі (LGN)[10]. МРНК Lynx1 і nAChR коекспресуються в LGN, а також в парвалбумін-позитивних ГАМК інтернейронах[10]. Після монокулярної депривації під час критичного періоду, що викликає амбліопію, моделі нокаутованих щурів Lynx1 спонтанно відновлювали нормальну гостроту зору, відкриваючи закрите око[10]. Подібним чином, введення фізостигміну для збільшення передачі сигналів ацетилхоліну викликало одужання від амбліопії у мишей дикого типу[10]. Інгібування Lynx1 може бути можливим терапевтичним механізмом для продовження синаптичної пластичності зорової кори і поліпшення бінокулярної функції при деяких типах амбліопії.

Крім того, було продемонстровано, що зниження експресії Lynx1, а також блокада довгострокової потенціації, що лежить в основі навчання і пам'яті, викликана Aβ1-42, можна запобігти шляхом інкубації з водорозчинним аналогом Lynx1. Результати показують, що водорозчинний аналог Lynx1 може бути перспективним засобом для поліпшення когнітивного дефіциту при нейродегенеративних захворюваннях[11].

Функції

Lynx1 діє в різних тканинах шляхом взаємодії з нікотиновими ацетилхоліновими рецепторами (nAChR)[12]. Запропонована роль модулятора активності nAChR, як видається, залежить від підтипу nAChR та стехіометрії, а також впливає на перенесення nAChR та його експресію на клітинній поверхні, а також на одноканальні властивості nAChR, вставлених у плазматичну мембрану. Lynx1 модулює функціональні властивості нікотинових ацетилхолінових рецепторів (nAChR) для запобігання надмірного збудження, а отже, і нейродегенерації. Також він підсилює десенсибілізацію, збільшуючи швидкість і ступінь десенсибілізації, що містять α42 nAChR і уповільнюючи відновлення після десенсибілізації. Lynx1 сприяє великій амплітуді ацетилхолін-викликаних струмів через α42 nAChR. Також залучений у регуляції пентамерному складанні nAChR в ендоплазматичному ретикулумі. Lynx1 зміщує стехіометрію від високої чутливості (α4)2:(β2)3 до низької чутливості (α4)3:(β2)2 nAChR. In vitro Lynx1 модулює nAChR, що складаються з α34 субодиниць. Також він запобігає пластичності в первинній зоровій корі в кінці життя[13].


Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Committee, HGNC:29604 (англ.) . Архів оригіналу за 8 травня 2021. Процитовано 2019-01.
  4. а б GeneCards®: The Human Gene Database, HGNC: 29604 (англ.) . Архів оригіналу за 6 січня 2019. Процитовано 2019-01.
  5. Gene: LYNX1 (ENSG00000180155) - GO: Cellular component - Homo sapiens - Ensembl genome browser 95. Процитовано 2019-01.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. lynx1 - SNP - NCBI. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 2019-01.
  7. LYNX1 Ly6/neurotoxin 1 [Homo sapiens] - Gene - NCBI. Архів оригіналу за 9 січня 2019. Процитовано 2019-01.
  8. Higley, Michael J.; Strittmatter, Stephen M. (26 листопада 2010). Neuroscience. Lynx for braking plasticity. Science (New York, N.Y.). Т. 330, № 6008. с. 1189—1190. doi:10.1126/science.1198983. ISSN 1095-9203. PMC 3244692. PMID 21109660. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 10 січня 2019.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  9. Miwa, Julie M.; Lester, Henry A.; Walz, Andreas (2012-8). Optimizing cholinergic tone through lynx modulators of nicotinic receptors: implications for plasticity and nicotine addiction. Physiology (Bethesda, Md.). Т. 27, № 4. с. 187—199. doi:10.1152/physiol.00002.2012. ISSN 1548-9221. PMID 22875450. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 10 січня 2019.
  10. а б в г д Morishita, Hirofumi; Miwa, Julie M.; Heintz, Nathaniel; Hensch, Takao K. (26 листопада 2010). Lynx1, a cholinergic brake, limits plasticity in adult visual cortex. Science (New York, N.Y.). Т. 330, № 6008. с. 1238—1240. doi:10.1126/science.1195320. ISSN 1095-9203. PMC 3387538. PMID 21071629. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 10 січня 2019.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  11. Bychkov, M. L.; Vasilyeva, N. A.; Shulepko, M. A.; Balaban, P. M.; Kirpichnikov, M. P.; Lyukmanova, E. N. (2018). Lynx1 Prevents Long-Term Potentiation Blockade and Reduction of Neuromodulator Expression Caused by Aβ1-42 and JNK Activation. Acta Naturae. Т. 10, № 3. с. 57—61. ISSN 2075-8251. PMC 6209405. PMID 30397527. Процитовано 10 січня 2019.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання)
  12. Lyukmanova, Ekaterina N.; Shenkarev, Zakhar O.; Shulepko, Mikhail A.; Mineev, Konstantin S.; D'Hoedt, Dieter; Kasheverov, Igor E.; Filkin, Sergey Yu; Krivolapova, Alexandra P.; Janickova, Helena (25 березня 2011). NMR structure and action on nicotinic acetylcholine receptors of water-soluble domain of human LYNX1. The Journal of Biological Chemistry. Т. 286, № 12. с. 10618—10627. doi:10.1074/jbc.M110.189100. ISSN 1083-351X. PMC 3060513. PMID 21252236. Архів оригіналу за 7 січня 2019. Процитовано 2019-01.{{cite news}}: Обслуговування CS1: Сторінки з PMC з іншим форматом (посилання) Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)
  13. LYNX1 - Ly-6/neurotoxin-like protein 1 precursor - Homo sapiens. Архів оригіналу за 9 січня 2019. Процитовано 2019-01.
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.