LIF (білок)

LIF

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1EMR, 1PVH, 2Q7N

Ідентифікатори

Символи

LIF, CDF, DIA, HILDA, MLPLI, leukemia inhibitory factor, interleukin 6 family cytokine, LIF interleukin 6 family cytokine

Зовнішні ІД

OMIM: 159540 MGI: 96787 HomoloGene: 1734 GeneCards: LIF

Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding • growth factor activity • cytokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • leukemia inhibitory factor receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір • гіалоплазма
Біологічний процес	• negative regulation of cell population proliferation • stem cell differentiation • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • spongiotrophoblast differentiation • lung development • positive regulation of histone H3-K27 acetylation • multicellular organism development • lung lobe morphogenesis • muscle organ morphogenesis • maternal process involved in female pregnancy • negative regulation of hormone secretion • leukemia inhibitory factor signaling pathway • regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • регуляція диференціювання клітин • GO:1901313 positive regulation of gene expression • stem cell population maintenance • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • positive regulation of astrocyte differentiation • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • neuron development • decidualization • positive regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • lung alveolus development • positive regulation of macrophage differentiation • blood vessel remodeling • trophoblast giant cell differentiation • lung vasculature development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of protein localization to nucleus • embryo implantation • negative regulation of meiotic nuclear division • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cell population proliferation • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • tyrosine phosphorylation of STAT protein • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


3976


16878

Ensembl


ENSG00000128342


ENSMUSG00000034394

UniProt


P15018


P09056

RefSeq (мРНК)


NM_001257135 NM_002309


NM_001039537 NM_008501

RefSeq (білок)


NP_001244064 NP_002300


NP_001034626 NP_032527

Локус (UCSC)

Хр. 22: 30.24 – 30.25 Mb

Хр. 11: 4.21 – 4.22 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

LIF (англ. LIF, interleukin 6 family cytokine) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 202 амінокислот, а молекулярна маса — 22 008^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKVLAAGVVP	LLLVLHWKHG	AGSPLPITPV	NATCAIRHPC	HNNLMNQIRS
QLAQLNGSAN	ALFILYYTAQ	GEPFPNNLDK	LCGPNVTDFP	PFHANGTEKA
KLVELYRIVV	YLGTSLGNIT	RDQKILNPSA	LSLHSKLNAT	ADILRGLLSN
VLCRLCSKYH	VGHVDVTYGP	DTSGKDVFQK	KKLGCQLLGK	YKQIIAVLAQ
AF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mori M., Yamaguchi K., Abe K. (1989). Purification of a lipoprotein lipase-inhibiting protein produced by a melanoma cell line associated with cancer cachexia. Biochem. Biophys. Res. Commun. 160: 1085—1092. PMID 2730639 DOI:10.1016/S0006-291X(89)80114-7
Boulanger M.J., Bankovich A.J., Kortemme T., Baker D., Garcia K.C. (2003). Convergent mechanisms for recognition of divergent cytokines by the shared signaling receptor gp130. Mol. Cell. 12: 577—589. PMID 14527405 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00365-4

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6596 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P15018 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.