SSBP1
| Протеин 1 везивања једноланчани ДНК, митохондријалне | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 PDB приказ базиран на 1s3o. | |||||||||||
| Доступне структуре | |||||||||||
| 1S3O, 2DUD, 3ULL | |||||||||||
| Идентификатори | |||||||||||
| Симболи | SSBP1; Mt-SSB; SOSS-B1; SSBP; mtSSB | ||||||||||
| Вањски ИД | OMIM: 600439 MGI: 1920040 HomoloGene: 74462 GeneCards: SSBP1 Gene | ||||||||||
| |||||||||||
| Преглед РНК изражавања | |||||||||||
 | |||||||||||
| подаци | |||||||||||
| Ортолози | |||||||||||
| Врста | Човек | Миш | |||||||||
| Ентрез | 6742 | 381760 | |||||||||
| Eнсембл | ENSG00000106028 | ENSMUSG00000029911 | |||||||||
| UниПрот | Q04837 | Q9CYR0 | |||||||||
| Реф. Секв. (иРНК) | NM_001256510 | NM_028358 | |||||||||
| Реф. Секв. (протеин) | NP_001243439 | NP_082634 | |||||||||
| Локација (УЦСЦ) | Chr 7: 141.44 - 141.49 Mb | Chr 6: 40.47 - 40.48 Mb | |||||||||
| ПубМед претрага | [1] | [2] | |||||||||
Протеин 1 везивања једноланчани ДНК, митохондријалне је протеин који је код људи кодиран SSBP1 геном.[1][2]
Референце
- ^ Tiranti V, Rossi E, Ruiz-Carrillo A, Rossi G, Rocchi M, DiDonato S, Zuffardi O, Zeviani M (1995). „Chromosomal localization of mitochondrial transcription factor A (TCF6), single-stranded DNA-binding protein (SSBP), and endonuclease G (ENDOG), three human housekeeping genes involved in mitochondrial biogenesis”. Genomics. 25 (2): 559—564. PMID 7789991. doi:10.1016/0888-7543(95)80058-T.
- ^ „Entrez Gene: SSBP1 single-stranded DNA binding protein 1”.
Литература
- Tiranti V, Rocchi M, DiDonato S, Zeviani M (1993). „Cloning of human and rat cDNAs encoding the mitochondrial single-stranded DNA-binding protein (SSB)”. Gene. 126 (2): 219—225. PMID 8482537. doi:10.1016/0378-1119(93)90370-I.
- Yang C, Curth U, Urbanke C, Kang C (1997). „Crystal structure of human mitochondrial single-stranded DNA binding protein at 2.4 A resolution”. Nat. Struct. Biol. 4 (2): 153—157. PMID 9033597. doi:10.1038/nsb0297-153.
- Schultz RA; Swoap SJ; McDaniel LD; et al. (1998). „Differential expression of mitochondrial DNA replication factors in mammalian tissues”. J. Biol. Chem. 273 (6): 3447—3451. PMID 9452467. doi:10.1074/jbc.273.6.3447.
- Spelbrink JN; Toivonen JM; Hakkaart GA; et al. (2000). „In vivo functional analysis of the human mitochondrial DNA polymerase POLG expressed in cultured human cells”. J. Biol. Chem. 275 (32): 24818—24828. PMID 10827171. doi:10.1074/jbc.M000559200.
- Müller-Höcker J, Schäfer S, Li K (2002). „Immunocytochemical localization of mitochondrial single-stranded DNA-binding protein in mitochondria-rich cells of normal and neoplastic human tissue”. Appl. Immunohistochem. Mol. Morphol. 9 (3): 276—280. PMID 11556757. doi:10.1097/00022744-200109000-00013.
- Takamatsu C; Umeda S; Ohsato T; et al. (2002). „Regulation of mitochondrial D-loops by transcription factor A and single-stranded DNA-binding protein”. EMBO Rep. 3 (5): 451—456. PMC 1084112
. PMID 11964388. doi:10.1093/embo-reports/kvf099. - Chen L; Segal D; Hukriede NA; et al. (2002). „Ssdp proteins interact with the LIM-domain-binding protein Ldb1 to regulate development”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (22): 14320—14325. PMC 137882 . PMID 12381786. doi:10.1073/pnas.212532399.
- Diez-Tascón C, Dodds KG, Crawford AM (2003). „Linkage mapping of the ovine single-stranded DNA-binding protein 1 (SSBP1) using microsatellite marker OARCDT7”. Anim. Genet. 33 (6): 468—468. PMID 12464025. doi:10.1046/j.1365-2052.2002.00938_1.x.
- Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; et al. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899—16903. PMC 139241 . PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899.
- Bayarsaihan D (2003). „SSDP1 gene encodes a protein with a conserved N-terminal FORWARD domain”. Biochim. Biophys. Acta. 1599 (1–2): 152—5. PMID 12479417. doi:10.1016/s1570-9639(02)00376-x.
- Scherer SW; Cheung J; MacDonald JR; et al. (2003). „Human chromosome 7: DNA sequence and biology”. Science. 300 (5620): 767—772. PMC 2882961 . PMID 12690205. doi:10.1126/science.1083423.
- Hillier LW; Fulton RS; Fulton LA; et al. (2003). „The DNA sequence of human chromosome 7”. Nature. 424 (6945): 157—164. PMID 12853948. doi:10.1038/nature01782.
- Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; et al. (2004). „The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)”. Genome Res. 14 (10B): 2121—2127. PMC 528928 . PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504.
- Pocernich CB; Poon HF; Boyd-Kimball D; et al. (2005). „Proteomic analysis of oxidatively modified proteins induced by the mitochondrial toxin 3-nitropropionic acid in human astrocytes expressing the HIV protein tat”. Brain Res. Mol. Brain Res. 133 (2): 299—306. PMID 15710247. doi:10.1016/j.molbrainres.2004.10.024.
- p
- r
- u
i inicijacija
| Prokariotska (inicijacija) | |
|---|---|
| Eukariotska (priprema u G1 fazi) | Prereplikacioni kompleks: Kompleks prepoznavanja mesta početka (ORC1, ORC2, ORC3, ORC4, ORC5, ORC6) · Održavanje minihromozoma (MCM2 · MCM3 · MCM4 · MCM5 · MCM6 · MCM7) · CDC6 Autonomna replikaciona sekvenca Protein jednolančanog vezivanja (SSBP1, SSBP2, SSBP3, SSBP4) Primaza: PRIM1 · PRIM2 |
| Oba | Početak replikacije/Ori/Replikon Replikaciona viljuška (zaostajući i vodeći lanci) · Okazakijev fragment · Prajmer |
| Prokariotska (elongacija) | DNK polimeraza III holoenzim (dnaC, dnaE, dnaH, dnaN, dnaQ, dnaT, dnaX, holA, holB, holC, holD, holE) · Replizom · DNK ligaza · DNK stega · Topoizomeraza (DNK giraza) Prokariotska DNK polimeraza: DNK polimeraza I (Klenov fragment) |
|---|---|
| Eukariotska (sinteza u S fazi) | |
| Oba | Kretanje: Procesivnost · DNK ligaza |
B bsyn: dnk (repl, cycl, reco, repr) · tscr (fact, tcrg, nucl, rnat, rept, ptts) · tltn (risu, pttl, nexn) · dnab, rnab/runp · stru (domn, 1°, 2°, 3°, 4°)
