Metaboloma

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Si definisce metaboloma^[1]^[2] l'insieme di tutti i metaboliti di un organismo biologico, cioè di tutte le sostanze che sono in grado di partecipare ai processi di un organismo. Tra di essi figurano sia gli intermedi metabolici (substrati necessari alle reazioni biochimiche e prodotti da esse derivati), sia ormoni ed altre molecole di segnale.

La parola è stata coniata in analogia con il termine trascrittoma e proteoma, a loro volta ideate ricalcando il ben più noto ed utilizzato genoma. A differenza di quest'ultimo, metaboloma, trascrittoma e proteoma sono entità estremamente dinamiche, in grado di cambiare da secondo a secondo.

La principale differenza del metaboloma rispetto alle altre tre entità, in ogni caso, è che non può al momento essere studiato attraverso una specifica tecnologia. Se infatti il genoma può essere studiato con varie tecniche di sequenziamento, il trascrittoma con saggi di espressione genica (specialmente attraverso i microarray) ed il proteoma con approcci come l'elettroforesi bidimensionale, non esiste ancora un metodo analitico in grado di tracciare il metaboloma.

Nel gennaio 2007 ricercatori delle Università dell'Alberta e di Calgary hanno completato l'analisi del metaboloma umano, individuando e caratterizzando circa 2500 metaboliti, 1200 principi attivi e 3500 componenti di origine alimentare.^[3]

Lo studio del metaboloma, similmente a quanto avviene per gli altri omics, è definito metabolomica (o metabonomica, termine che tuttavia è spesso utilizzato con un significato leggermente diverso).

Note

^ Il primo uso del termine metaboloma in letteratura: Oliver SG, Winson MK, Kell DB, Baganz F, Systematic functional analysis of the yeast genome, in Trends Biotechnol., vol. 16, n. 9, settembre 1998, pp. 373–8, DOI:10.1016/S0167-7799(98)01214-1, PMID 9744112.
^ Il primo libro sulla metabolomica: Harrigan, G. G. & Goodacre, R. (eds), Metabolic Profiling: Its Role in Biomarker Discovery and Gene Function Analysis, Kluwer Academic Publishers (Boston), 2003, ISBN 978-1-4020-7370-0.
^ Scientists complete human metabalome Archiviato il 30 settembre 2007 in Internet Archive.

Bibliografia

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Wishart DS, Knox C, Guo AC, Eisner R, Young N, Gautam B, Hau DD, Psychogios N, Dong E, Bouatra S, Mandal R, Sinelnikov I, Xia J, Jia L, Cruz JA, Lim E, Sobsey CA, Shrivastava S, Huang P, Liu P, Fang L, Peng J, Fradette R, Cheng D, Tzur D, Clements M, Lewis A, De Souza A, Zuniga A, Dawe M, Xiong Y, Clive D, Greiner R, Nazyrova A, Shaykhutdinov R, Li L, Vogel HJ, Forsythe I, HMDB: a knowledgebase for the human metabolome, in Nucleic Acids Research, 37 (Database issue), gennaio 2009, pp. D603–10, DOI:10.1093/nar/gkn810, PMID 18953024.
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Voci correlate

Esposoma
Esposomica

Collegamenti esterni

(EN) The Human Metabolome Project, su metabolomics.ca.
(EN) The Human Metabolome Database, su hmdb.ca.
(EN) The Human Metabolite Library, su metabolibrary.ca.
(EN) The Human Serum Metabolome Project (HUSERMET), su husermet.org. URL consultato il 19 aprile 2009 (archiviato dall'url originale il 17 maggio 2014).
(EN) PDF of Reporting Standards for Metabolomic Studies, su liebertonline.com.