CPSF4

بنى متوفرة

Ortholog search: PDBe RCSB

قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
2D9N, 2RHK

معرفات

أسماء بديلة

CPSF4, CPSF30, NAR, NEB1, NEB-1, cleavage and polyadenylation specific factor 4

معرفات خارجية

الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 603052 MGI: MGI:1861602 HomoloGene: 38216 GeneCards: 10898

علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ربط حمض نووي • ربط أيون الزنك • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني • ربط أيون فلزي • endoribonuclease activity • RNA binding
مكونات خلوية	• عامل متخصص بالقص وعديد الأدينيلات • نواة • بلازم نووي • intracellular membrane-bounded organelle
عمليات حيوية	• mRNA processing • modification by virus of host mRNA processing • ‏GO:0022415 viral process • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
المصادر:Amigo / QuickGO

نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي

المزيد من بيانات التعبير المرجعية

تماثلات متسلسلة

أنواع

الإنسان

الفأر

أنتريه

10898

54188

Ensembl

ENSG00000160917

ENSMUSG00000029625

يونيبروت


O95639 C9JEV9


Q8BQZ5

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_006693، ‏XM_011515755، ‏XM_011515756، ‏XM_011515757، ‏NM_001318160، ‏NM_001318161، ‏NM_001318162، ‏XM_017011703، ‏XM_047419824، ‏XM_047419825، ‏XM_047419826، ‏XM_047419827 NM_001081559، ‏NM_006693، ‏XM_011515755، ‏XM_011515756، ‏XM_011515757، ‏NM_001318160، ‏NM_001318161، ‏NM_001318162، ‏XM_017011703، ‏XM_047419824، ‏XM_047419825، ‏XM_047419826، ‏XM_047419827


‏NM_001291249، ‏NM_178576، ‏NM_001374716 NM_001291248، ‏NM_001291249، ‏NM_178576، ‏NM_001374716

RefSeq (بروتين)

‏NP_001305089، ‏NP_001305090، ‏NP_001305091، ‏NP_006684، ‏XP_011514057، ‏XP_011514058، ‏XP_011514059، ‏XP_016867189، ‏XP_016867190، ‏XP_016867191، ‏XP_016867192 NP_001075028، ‏NP_001305089، ‏NP_001305090، ‏NP_001305091، ‏NP_006684، ‏XP_011514057، ‏XP_011514058، ‏XP_011514059، ‏XP_016867189، ‏XP_016867190، ‏XP_016867191، ‏XP_016867192


‏NP_001278178، ‏NP_848671، ‏NP_001361645 NP_001278177، ‏NP_001278178، ‏NP_848671، ‏NP_001361645

الموقع (UCSC

n/a

Chr 5: 145.1 – 145.12 Mb

بحث ببمد

[1]

[2]

ويكي بيانات

اعرض/عدّل إنسان

اعرض/عدّل فأر

CPSF4‏ (Cleavage and polyadenylation specific factor 4) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين CPSF4 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

^ Nemeroff ME، Barabino SM، Li Y، Keller W، Krug RM (يوليو 1998). "Influenza virus NS1 protein interacts with the cellular 30 kDa subunit of CPSF and inhibits 3'end formation of cellular pre-mRNAs". Mol Cell. ج. 1 ع. 7: 991–1000. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80099-4. PMID:9651582.
^ "Entrez Gene: CPSF4 cleavage and polyadenylation specific factor 4, 30kDa". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Barabino SM، Hubner W، Jenny A، Minvielle-Sebastia L، Keller W (أغسطس 1997). "The 30-kD subunit of mammalian cleavage and polyadenylation specificity factor and its yeast homolog are RNA-binding zinc finger proteins". Genes Dev. ج. 11 ع. 13: 1703–16. DOI:10.1101/gad.11.13.1703. PMID:9224719.

قراءة متعمقة

Jenny A، Hauri HP، Keller W (1994). "Characterization of cleavage and polyadenylation specificity factor and cloning of its 100-kilodalton subunit". Mol. Cell. Biol. ج. 14 ع. 12: 8183–90. PMC:359357. PMID:7969155.
Thuresson AC، Aström J، Aström A، وآخرون (1994). "Multiple forms of poly(A) polymerases in human cells". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 91 ع. 3: 979–83. DOI:10.1073/pnas.91.3.979. PMC:521437. PMID:8302877.
Hillier LD، Lennon G، Becker M، وآخرون (1997). "Generation and analysis of 280,000 human expressed sequence tags". Genome Res. ج. 6 ع. 9: 807–28. DOI:10.1101/gr.6.9.807. PMID:8889549.
McCracken S، Fong N، Yankulov K، وآخرون (1997). "The C-terminal domain of RNA polymerase II couples mRNA processing to transcription". Nature. ج. 385 ع. 6614: 357–61. DOI:10.1038/385357a0. PMID:9002523.
de Vries H، Rüegsegger U، Hübner W، وآخرون (2000). "Human pre-mRNA cleavage factor II(m) contains homologs of yeast proteins and bridges two other cleavage factors". EMBO J. ج. 19 ع. 21: 5895–904. DOI:10.1093/emboj/19.21.5895. PMC:305781. PMID:11060040.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
Scherer SW، Cheung J، MacDonald JR، وآخرون (2003). "Human chromosome 7: DNA sequence and biology". Science. ج. 300 ع. 5620: 767–72. DOI:10.1126/science.1083423. PMC:2882961. PMID:12690205.
Kaufmann I، Martin G، Friedlein A، وآخرون (2005). "Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase". EMBO J. ج. 23 ع. 3: 616–26. DOI:10.1038/sj.emboj.7600070. PMC:1271804. PMID:14749727.
Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
Rual JF، Venkatesan K، Hao T، وآخرون (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514.
Oh JH، Yang JO، Hahn Y، وآخرون (2006). "Transcriptome analysis of human gastric cancer". Mamm. Genome. ج. 16 ع. 12: 942–54. DOI:10.1007/s00335-005-0075-2. PMID:16341674.
Twu KY، Kuo RL، Marklund J، Krug RM (2007). "The H5N1 influenza virus NS genes selected after 1998 enhance virus replication in mammalian cells". J. Virol. ج. 81 ع. 15: 8112–21. DOI:10.1128/JVI.00006-07. PMC:1951328. PMID:17522219.